陽(yáng)泉市熱啟動(dòng)Taq酶應(yīng)用領(lǐng)域
發(fā)布時(shí)間:2024-05-09 01:14:33
陽(yáng)泉市熱啟動(dòng)Taq酶應(yīng)用領(lǐng)域
大部分分子診斷實(shí)驗(yàn)室的核心技術(shù)都主要集中在檢測(cè)特異性、相對(duì)較短的DNA或RNA片段上。該技術(shù)能診斷傳染性疾病、鑒別影響藥物代謝的特殊基因變異型或檢測(cè)與疾病有關(guān)的基因,如與癌癥有關(guān)的基因。這些檢測(cè)的核心是實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)擴(kuò)增(TMA)、靶向擴(kuò)增和信號(hào)擴(kuò)增等類似技術(shù)的應(yīng)用。桑格排序和DNA片段分析或采用毛細(xì)電泳法的凝膠法都是分子診斷實(shí)驗(yàn)室的關(guān)鍵技術(shù),但他們通常還包括檢測(cè)過(guò)程中的擴(kuò)增步驟。為了能順利應(yīng)用那些采用DNA和RNA來(lái)診斷疾病的檢測(cè),分子診斷實(shí)驗(yàn)室須要使用定義明確的工作流程,從而得到穩(wěn)定的、有效的結(jié)果,而當(dāng)前已存在能幫助診斷實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)每個(gè)工作流程流水化的特殊工具。

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分子診斷的主要技術(shù)有核酸分子雜交、聚合酶鏈反應(yīng)和生物芯片技術(shù)。1.核酸分子雜交技術(shù) 具有一定互補(bǔ)序列和核苷酸單鏈在液相或固相中按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則締合成異質(zhì)雙鏈的過(guò)程,稱為核酸分子雜交。雜交的雙方是待測(cè)核酸序列和探針序列。應(yīng)用該技術(shù)可對(duì)特定DNA或RNA序列進(jìn)行定性或定量檢測(cè)。2.聚合酶鏈反應(yīng)(即Polymerase chain reaction,PCR)原理:PCR是模板DNA,引物和四種脫氧核糖核昔三磷酸(dNTP)在DNA聚合酶作用下發(fā)生酶促聚合反應(yīng),擴(kuò)增出所需目的DNA。包括三個(gè)基本步驟:雙鏈DNA模板加熱變性成單鏈(變性);在低溫下引物與單鏈DNA互補(bǔ)配對(duì)(退火);在適宜溫度下TapDNA聚合酶催化引物沿著模板DNA延伸。3.生物芯片技術(shù)是近年發(fā)展起來(lái)的分子生物學(xué)與微電子技術(shù)相結(jié)合的核酸分析檢測(cè)技術(shù)。起初的生物芯片技術(shù)主要目標(biāo)是用于DNA序列測(cè)定、基因表達(dá)譜鑒定和基因突變體檢測(cè)和分析,所以又稱為DNA芯片或基因芯片技術(shù)。由于這一技術(shù)已擴(kuò)展至免疫反應(yīng)、受體結(jié)合等非核酸領(lǐng)域,出現(xiàn)了蛋白質(zhì)芯片、免疫芯片、細(xì)胞芯片、組織芯片等,所以改稱生物芯片技術(shù)更符合發(fā)展趨勢(shì)。

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熱啟動(dòng)酶是耐高溫的依賴于DNA模板的DNA聚合酶,來(lái)源于嗜熱的嗜熱水生菌Thermus aquaticus YT一1,一般應(yīng)用于PCR反應(yīng)。TaqDNA聚合酶是一種M92+依賴酶,反應(yīng)體系中須有Mg2+存在,然而保持適當(dāng)?shù)腗g2+濃度十分重要,因?yàn)镸g2+濃度過(guò)高或過(guò)低均會(huì)影響引物與模板的結(jié)合、模板與PCR產(chǎn)物的解鏈溫度、引物二聚體的形成以及酶的活性與精 確性。

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Taq酶的酶動(dòng)力與擴(kuò)增效率有關(guān)。一般熱啟動(dòng)Taq酶的酶動(dòng)力越強(qiáng),PCR擴(kuò)增的指數(shù)增長(zhǎng)期越長(zhǎng),‘S型’曲線更加典型,熒光信號(hào)值更高,而且更適合做多重PCR檢測(cè)。我們?cè)容^過(guò)多家公司的熱啟動(dòng)Taq酶,在國(guó)外品牌中,英國(guó)Bioline公司的熱啟動(dòng)Taq酶,酶動(dòng)力較好,可做4重PCR,等量起始模板CT30時(shí)的熒光信號(hào)值高。在國(guó)內(nèi)品牌中,BIOG熱啟動(dòng)Taq酶的指數(shù)期較長(zhǎng),可做3重PCR,且擴(kuò)增曲線的‘S’型不受影響,其它的國(guó)產(chǎn)品牌一般只能支持2重反應(yīng),在做3重反應(yīng)時(shí),擴(kuò)增曲線低矮,熒光信號(hào)值較低,無(wú)典型擴(kuò)增曲線,結(jié)果很難判定。

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常規(guī)普通PCR常見問(wèn)題:1. 優(yōu)化反應(yīng)條件,梯度摸索退火溫度,延長(zhǎng)退火延伸時(shí)間,增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)(30-45區(qū)間為宜)。2. 對(duì)核酸模板進(jìn)行純化,或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進(jìn)行提取,增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系(預(yù)混體系除外),改變檢測(cè)體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量,更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計(jì)引物,避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級(jí)結(jié)構(gòu),在一次稀釋引物后可分裝成多支小管,減少反復(fù)凍融次數(shù)。